Jojo é um jovem garoto alemão que sonha entrar para a Juventude Hitlerista, mas tudo muda quando ele conhece uma jovem garota judia que a sua mãe está ajudando a esconder.
Com um humor sarcástico e que transforma os nazistas em motivo de piada, Jojo Rabbit cria uma história divertida e acolhedora sobre amizade e superação de diferenças, ao mesmo tempo em que cutuca o público com os horrores da guerra e uma mudança rápida de tom.